Aby organizace získala formální náboženské uznání v Itálii, musí organizace projít dvěma kroky. Prvním krokem je proces, při kterém subjekt zastupující náboženské vyznání v Itálii na národní úrovni získá uznání právní subjektivity od Ministerstva vnitra. Po podání žádosti Ministerstvo vnitra provede šetření kvalifikace žadatele a po přijetí jej zaregistruje jako uznané náboženské sdružení. Jakmile je tento proces dokončen a je získáno náboženské uznání od Ministerstva vnitra, je možné učinit další krok a vyjednat s ​​státem smlouvu zvanou Intesa. Jedná se o zvláštní dohodu se státem a je nejvyšší formou náboženského uznání. Scientologická církev se nikdy nesnažila o získání náboženského uznání tímto procesem. Místo toho jsou její náboženské organizace v Itálii registrovány jako náboženské neziskové organizace.

Účely a činnosti Scientologické církve byly nejvyšším italským soudem uznány jako náboženské povahy. Italský kasační soud (nejvyšší soudní orgán Itálie) vydal v říjnu 1997 přelomové rozhodnutí ve věci Bandera a další proti Itálii (č.16835/97), ve kterém uznal Scientologii jako náboženské vyznání (což znamená, že má náboženský účel a provozuje náboženské aktivity). Soud analyzoval kritéria pro definici náboženství, zdůraznil povinnost vlády neomezovat náboženskou svobodu a dospěl k závěru, že Scientologie je náboženské vyznání.

V únoru a srpnu 1998 ministr financí osvobodil Scientologickou církev od daní a klasifikoval ji jako „náboženská nezisková organizace“.

Scientologická církev byla také uznána jako náboženství v mnoha dalších soudních a správních rozhodnutích v Itálii. Toto jednoznačné náboženské uznání potvrdil italský Nejvyšší soud v dalším rozhodnutí v roce 2001, ve kterém se opíral o četné a nyní převažující judikatury, které zjistily, že scientologie je náboženská denominace.